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TABELA 1. Caracterização das sequências amplificadas da região da integrase de clones da amostra 35789 e
dos clones-controles A4aP, a3IVaE e B190D com relação à composição nucleotídica eTemperatura de Melting.
CLONE % A (número) % T (número) % G (número) % C (número) Conteúdo A + T
T Melting da Sequência (°C)
35789_01 37,27 (186) 21,24 (106) 24,85 (124) 16,63 (83) 58,52 (292) 80,91
35789_02 37,47 (187) 20,84 (104) 25,05 (125) 16,63 (83) 58,32 (291) 80,99
35789_04 48,70 (243) 21,04 (105) 13,63 (68) 16,63 (83) 69,74 (348) 76,30
35789_05 38,08 (190) 20,84 (104) 24,45 (122) 16,63 (83) 58,92 (294) 80,74
35789_06 37,27 (186) 20,84 (104) 25,25 (126) 16,63 (83) 59,00 (296) 81,07
35789_08 36,76 (185) 21,30 (107) 24,63 (124) 16,36 (82) 58,63 (294) 81,04
35789_09 37,27(186) 20,84 (104) 25,25 (126) 16,63 (83) 58,12 (290) 81,07
35789_10 43,49 (217) 21,24 (106) 19,04 (95) 16,23 (81) 64,73 (323) 78,36
35789_13 40,28 (201) 20,64 (103) 22,24 (111) 16,83 (84) 60,92 (304) 79,92
35789_15 38,08 (190) 20,84 (104) 24,25 (121) 16,83 (84) 58,92 (294) 80,74
35789_17 48,70 (243) 21,04 (105) 13,63 (68) 16,63 (83) 69,74 (348) 76,30
35789_21 41,28 (206) 21,24 (106) 21,24 (106) 16,23 (81) 62,53 (312) 79,26
35789_25 36,87 (184) 21,24 (106) 25,65 (128) 16,23 (81) 58,12 (290) 81,07
35789_26 41,97 (209) 21,29 (106) 20,28 (101) 16,47 (82) 63,25 (315) 78,96
35789_27 36,27 (181) 21,44 (107) 26,05 (130) 16,23 (81) 57,72 (288) 81,23
35789_28 49,00 (245) 20,80 (104) 13,60 (68) 16,60 (83) 69,80 (349) 76,28
35789_30 37,25 (187) 21,12 (106) 25,10 (126) 16,14 (81) 58,37 (293) 80,81
35789_31 36,87 (184) 21,24 (106) 25,65 (128) 16,23 (81) 58,12 (290) 81,07
35789_33 48,19 (240) 21,29 (106) 13,86 (69) 16,67 (83) 69,48 (346) 76,41
35789_35 41,20 (206) 21,00 (105) 21,20 (106) 16,40 (82) 62,20 (311) 79,32
C. Hipermutado (A4aP) 46,98 (233) 22,38 (111) 14,52 (72) 16,13 (80) 69,35 (344) 76,46
C. Normal (B190H) 37,20 (186) 21,80 (109) 25,20 (126) 15,60 (78) 59,00 (295) 80,63
C. Intermediário (A3IVaE) 36,47 (182) 21,04 (105) 25,45 (127) 17,03 (85) 57,52 (287) 81,32
4.6 CARACTERIZAÇÃO E ESTUDO DOS CLONES SEQÜENCIADOS
As sequências dos clones utilizados como controle nos géis das amostras clínicas,
bem como o conjunto de 20 clones obtido da amostra 35789 do paciente 99 foram
submetidas a uma série de análises com o objetivo de validar uma metodologia capaz de
distinguir amostras hipermutadas de amostras não hipermutadas utilizando um critério que
integrasse o resultado que o software Hypermut fornece ao deslocamento foto
documentado de uma amostra num gel. O Hypermut é uma ferramenta disponível no site
do Laboratório de Los Alamos, como dito anteriormente, que tem sido utilizada para inferir